MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC2

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007487	CAC	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_007487	GGA	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007487	GCC	2	6	1888	1893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007487	GCA	2	6	1900	1905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007487	TGGGGG	2	12	1925	1936	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007487	GCC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007487	TG	3	6	1965	1970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007487	CGGAAA	2	12	1992	2003	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007487	CG	3	6	2041	2046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007487	TCGGCG	2	12	2105	2116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007487	AGA	2	6	2186	2191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007487	GT	3	6	2228	2233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007487	TTC	2	6	2254	2259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007487	GAC	2	6	2271	2276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007487	TGG	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007487	AGCA	2	8	2451	2458	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007487	GC	3	6	2539	2544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007487	GT	3	6	2568	2573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007487	ACG	2	6	2644	2649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007487	CCG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007487	CGT	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007487	CAGCG	2	10	2713	2722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_007487	CCG	3	9	2792	2800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007487	CTC	2	6	2803	2808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007487	TCGC	2	8	2813	2820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007487	CCCG	2	8	2824	2831	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_007487	CAC	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007487	CCG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007487	CA	3	6	2983	2988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007487	CGG	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007487	CCA	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007487	CAC	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_007487	CACCCT	2	12	3050	3061	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007487	AC	3	6	3070	3075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007487	TCC	2	6	3093	3098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007487	ACC	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007487	ACGC	2	8	3121	3128	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007487	CGGC	2	8	3146	3153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007487	CGGC	2	8	3162	3169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007487	CGGC	2	8	3178	3185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007487	CGGC	2	8	3194	3201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007487	CGGC	2	8	3210	3217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007487	CGGC	2	8	3226	3233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007487	CGGC	2	8	3242	3249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007487	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007487	AAC	2	6	3276	3281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007487	GC	3	6	3303	3308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007487	ACCT	2	8	3317	3324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007487	AGC	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007487	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007487	CACC	2	8	3363	3370	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_007487	AGA	2	6	3460	3465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007487	TGG	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007487	GGA	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007487	AAT	2	6	3571	3576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007487	GGGC	2	8	3619	3626	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.